南京紫金医院是由第二军医大学南京军医学院（原海军医学高等专科学院）航潜教研室、高压氧实验室组合成立的脑血管病康复中心（1987）发展而来，1993年经南京市卫生局批准更名为“南京紫金医院”。

医院主要从事脑复苏、脊髓损伤和各种缺血缺氧引起疾病的研究和治疗康复工作。医院拥有一支由60余名国内**专家组成的医院专家医疗指导队伍，工作人员近200余名。