甘肃中医药大学附属医院的前身是1978年建立的甘肃中医学院畅家巷门诊部，1991年由省委、省政府投资建设的2万平方米医院住院部大楼正式投入使用。2014年3月由国家和医院共同投资建设的2万平方米的新门诊外科综合大楼投入使用。新门诊外科大楼的使用，极大的改善了患者就诊环境与条件。

医院目前是一所中医特色浓厚，临床科室齐全，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复和急救为一体的三级甲等中医医院。主要承担甘肃中医大学的临床教学任务，为社会民众提供中医诊疗服务，并开展中医药相关科学研究。

医院现有兰州本部及皋兰、西固两个分院，下辖嘉峪关路社区卫生服务中心、酒泉路社区卫生服务站、兰州市老年公寓门诊。