厦门大学附属心血管病医院现有齐全的心脏专科病区：心血管内科、心血管外科、心脏导管室、心脏手术室、心脏彩超室、心功能检查室、心内科CCU、心外科ICU、心外科麻醉与体外循环组、心血管内外科专科门诊。心血管内科下设心脏电生理研究室、高血压病研究室等，心外科下设先天性心脏病研究组、瓣膜与心力衰竭研究组等，心脏彩超室下设心超研究室。 如此多功能高度一体化的专业设置，使得整个医院的团队协作战斗力十分强大。在同一幢楼房里，患者可以在最短的时间内接受全方位的专业诊疗。 十余年来，医院不断引进国际先进的专业设备，在原投入数千万元设备的基础上，再次引进全球**的西门子数字平板双球管血管造影机，成为全省惟一具有两台数字减影机的单位。此外，该中心还拥有东南亚首台具有血管内斑块组织分析功能的血管内超声、省内首台远程心电遥测监护仪以及具有组织多普勒功能的Vivid7超声心动仪等。

2015年12月，获批成为“国家胸痛中心区域认证中心”，为全国四家之一。2015年10月，获国家人社部批准成立国家博士后科研工作站。2015年7月，获批成为“第五批福建省院士专家工作站”设站单位。2014年12月，获批建立“厦门市院士专家工作站”，为我市首批。2014年4月，胸痛中心通过中国胸痛中心首批认证、美国胸痛中心协会国际认证。2013年1月，获美国心脏协会授权，成立“美国心脏学会专业示范中心”。2012年4月，心内科获评卫生部心律失常介入诊疗培训基地。2012年3月，获福建省卫生厅评定为福建省儿童重大疾病（先天性心脏病）定点救治医院。2011年，心内科被评为国家临床重点专科。2010年6月，获美国心脏病学院授权成为首批美国心脏病学院（ACC）中国教育基地2008年12月，被评为卫生部**批心血管介入诊疗培训基地，成为首批**心血管介入人才培训中心。