崇明县传染病医院配置了先进的医疗仪器，拥有630MA多功能数字化X光机、放射成像系统、彩色多普勒诊断系统、全自动生化分析仪、微生物鉴定及药敏分析系统、时间分辨荧光免疫分析系统、重危监护系统、心肺功能检测仪、腹水回收治疗仪、肝病治疗仪、支气管镜、人工肝及呼吸机等一系列高精尖仪器