吉林大学第二医院前身是1936年11月建成的伪满洲国新京特别市立医院。医院位于长春市南关区自强街218号。现是一家集医疗、教学、科研、康复、保健于一体的现代化三级甲等综合性临床医学院。
医院的仪器设备不断更新，有国际**的核磁共振机、数字减影机、64排螺旋CT机、眼科准分子激光曲光系列矫正仪、全国**的NT系列内镜图像显示仪、彩色多普勒、眼科玻璃体切割机、激光视网膜脉络膜造影系统、全自动生化分析仪、直线加速器、钴60 放射治疗机等大型仪器设备300余台件。
1993年9月学院通过了卫生部检查团的验收检查，为吉林省内综合医院首家**爱婴医院，1994年4月又进入卫生部三级甲等医院行列。2001年10月 在中华医学会举办的“让患者明明白白看病，争创百姓放心医院”活动中被评为全国首批“百姓放心医院”。