华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。1937年抗日战争全面爆发，中央大学、燕京大学、齐鲁大学、金陵大学、金陵女子文理学院内迁成都，与华西协合大学联合办学办医，是时，华西坝大师云集、名家汇萃、盛况空前。1938年，有医学院的华大、中大、齐大组建联合医院；1946年，华西协合大学医院在现址全部建成，简称华西医院。1951年，新中国人民政府接管华西协合大学；1953年，经院系调整为四川医学院，医院更名为四川医学院附属医院；1985年，四川医学院更名为华西医科大学，医院更名为华西医科大学附属**医院；2000年，四川大学与华西医科大学合并，2001年5月，学院/医院更名为四川大学华西临床医学院/华西医院。

医院医疗区占地500余亩，业务用房50余万平方米，编制床位4300张，在职员工八千余人；现设成都国学巷本部院区、温江院区，全托管成都上锦南府医院（简称上锦分院）。