滁州市中西医结合医院于2004年8月，经安徽省卫生厅、滁州市人民政府批准，由原滁州市第三人民医院和原滁州市中医院合并组建而成。医院2005年8月开诊，是国家中医药管理局、国家发展和改革委员会确定的全国重点中西医结合医院、全国重点地市级中医院，同时也是安徽省内的三级甲等中西医结合医院。