南通市中医院始建于1956年，是首批“三级甲等中医院”和“全国示范中医院”之一、南京中医药大学南通附属医院和南通大学附属南通中医院。
医院科室设置齐全，人才济济，设备先进，专科特色显著。共有一级临床和医技科室25个，二级临床科室13个，核定床位800张。医院现有职工1073人，具有**职称者181人，硕博士143人。
医院拥有核磁共振、螺旋CT、DSA、数字X光机、C臂X光机、数字X线成像系统、全自动生化仪、彩超、电子胃镜、钬激光、准分子激光等大型仪器设备。
南通市中医院是“三级甲等中医院”和“全国示范中医院”、南京中医药大学教学医院和南通大学附属医院。先后获得“全国红旗单位”、“全国医药卫生先进集体”、“省文明医院”、“省、市文明单位”、“省抗非先进集体”、“南通市服务经济建设**单位”、“市十佳医院”等称号。二项科研获得市政府科技进步二等奖；一项成果获2005年中华中医药学会科技三等奖。